Systeemfuncties zijn volgens het IZA functies die zijn gericht op het onderhouden van een netwerk, infrastructuur of organisatie om de zorglevering heen. Ze zijn niet aan een individuele patiënt of zorgaanbieder toe te wijzen. In de praktijk zal het volgens het IZA gaan om twee soorten functies. Ofwel het zijn functies die te maken hebben met coördinatie van zorg, zoals in de acute zorg of voor kortdurend verblijf. Ofwel het zijn functies die qua schaal alleen doelmatig kunnen worden georganiseerd op regionaal niveau, zoals onplanbare nachtzorg, een regionale ambulancevoorziening en huisartsenposten. Volgens IZA moeten zorgaanbieders, zorgverzekeraars en de overheid in 2023 afspraken hebben gemaakt over welke functies onder systeemfuncties vallen, zodat passende inkoopafspraken kunnen worden gemaakt die zowel de kwaliteit waarborgen als financieel doelmatig zijn. 

De IZA-thematafel Contractering heeft een werkdefinitie van systeemfunctie opgesteld. Zorgmarkten onderzocht welke functies onder deze definitie vallen en of de definitie moest worden aangescherpt. Zorgmarkten raadpleegde 25 experts uit diverse werkterreinen, zoals zorgeconomen, bekostigingsexperts, mededingingsexperts, bestuurders van zorgnetwerken en zorginkoopmanagers van zorgverzekeraars, voor hun inzichten. Op basis van dit onderzoek stelde Zorgmarkten voor om het proces in drie stappen te vervolgen: eerst moet overeenstemming komen over de doelstelling, reikwijdte en criteria voor systeemfuncties. Hiervoor heeft Zorgmarkten ook aangepaste definities voorgesteld. Daarna moet een procedure worden vastgesteld voor het aanmeld- en toetsingsproces, inclusief beslisschema’s voor regelgeving, bekostiging en inkoopmodellen. Tot slot moeten kandidaat-systeemfuncties getoetst worden om te bepalen of aanpassingen nodig zijn en welk inkoopmodel het beste past.